viernes, 15 de marzo de 2019

ANOMALÍAS FETALES ESTRUCTURALES- CARIOTIPO- ARRAY - WES


lectura

Introduction of genomics into prenatal diagnostics


Michael E Talkowski


The Lancet
January 31, 2019 http://dx.doi.org/10.1016/ S0140-6736(19)30193-X

El cariotipo detecta anomalías cromosómicas y translocaciones – se ha mantenido como estudio genético durante décadas.

En el año 2000 se incorporó el micro-ARRAY que revela alteraciones cromosómicas sub microscópicas, con los que se duplicaron los diagnósticos de alteraciones en fetos con anomalías estructurales (6%). Con la salvedad (y a diferencia del cariotipo) no detecta translocaciones balanceadas.

Paralelamente se ha desarrollado el WES (whole-exome sequencing) que es un estudio genómico a través de las proteínas que los genes secuencia.

 Dos estudios evaluaron recientemente el valor de WES en el diagnóstico prenatal.

 Lord J,. Prenatal exome sequencing analysis in fetal structural anomalies detected by ultrasonography (PAGE): a cohort study. Lancet 2019; published online Jan 31. http://dx.doi.org/10.1016/S0140-6736(18)31940-8.

 Petrovski S. Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study. Lancet 2019; published online Jan 31. http://dx.doi.org/10.1016/S0140- 6736(18)32042-7

 El primer estudio evalúa una cohorte de 610 fetos con anomalías estructurales y el segundo una de 234-  Todos escaneados con cariotipo. Esta metodología básicamente cuadriplica o quintuplica los diagnósticos por cariotipo y duplica los de m-ARRAY.
 La gran mayoría se trata de mutaciones de novo.

 Una fuente de debate es la interpretación de los resultados- El primer estudio (PAGE) lo compara con una base de datos- panel de 1628 genes, relacionados a anomalías estructurales. Los diagnósticos posibles son sujetos a revisión manual.

 El segundo estudio toma 1182 genotipos pero son revisados por varias personas, siempre hay variantes que se pueden encontrar en individuos sin anomalías.

 Ambos estudios ponen énfasis en la revisión manual y re interpretación.

 Estos 2 estudios se consideran la base de la introducción de WES en el diagnóstico prenatal. Al igual que ARRAY no detecta translocaciones por lo que debe ir precedido del estudio citogenético clásico.

 La combinación de ambos (cariotipo + WES) mejora sustancialmente el diagnóstico en fetos con anomalías, (el doble que cariotipo + ARRAY que ya duplica al cariotipo aislado).



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