Estudios
genéticos en diagnóstico prenatal. Recomendación (2018)
Pilar Carrasco Salas
Revista del Laboratorio Clínico
Publicado January 1, 2019. Volume 12, Issue 1. Páginas
27-37.
Aunque la gran mayoría de malformaciones (50-60%) son de
causa desconocida, se estima que un 25% puede deberse a factores genéticos. Pueden
ser
1.
Cromosomopatías numéricas o estructurales
2.
Enfermedades monogénicas: causadas por mutación
de un solo gen.
3.
Enfermedades poligénicas/multifactoriales
A- cariotipo para detectar algunas anomalías cromosómicas
- biopsia corial (semana 11 a 14)
- Amniocentesis (luego de semana 15)
- Cordocentesis (luego de semana 20)
- Técnicas no invasivas en sangre materna
En estudios de screening del primer trimestre de riesgo alto
se recomienda pasar a pruebas invasivas
B- Indicaciones de pruebas invasivas directas o diagnóstico pre-
implantacionales
2 Progenitor(es) portador(es) de alteraciones
cromosómicas: translocaciones, inversiones, deleciones o duplicaciones, con el
fin de descartar segregaciones desequilibradas.
3.
Riesgo ≥ 1:50 en el cribado combinado de
primer trimestre o en cribado bioquímico segundo trimestre
4.
Estudio materno no invasivo con alta
probabilidad de trisomía 13-18-21-
5.
TN ≥ P99 (o ≥ 3,5 mm) en la ecografía del primer
trimestre
6.
. Hidropesía no inmune (HNI)
7.
Presencia de marcadores ecográficos secundarios-
ductus venoso (flujo patológico)- hueso nasal (hipoplasia nasal ≤ 3,5 mm o
ausencia de hueso nasal) y regurgitación tricuspídea
8.
Presencia de malformaciones fetales
9.
Restricción del crecimiento intrauterino
(RCIU/CIR) precoz (inicio antes de las 24 semanas), severo (< P3) y sin
alteraciones en la ecografía Doppler compatibles con insuficiencia placentaria
Técnicas de análisis para la detección prenatal de alteraciones
genéticas
a-El cariotipo
Las anomalías cromosómicas que se pueden detectar pueden ser
numéricas o estructurales y pueden afectar a uno o más autosomas, a los
cromosomas sexuales o a ambos simultáneamente
El cariotipo fetal se lleva a cabo mediante el análisis de
células in vitro obtenidas con una prueba invasiva- necesita cultivo si es LA.
En vellosidad puede no necesitar. Cuanto más lento el cultivo más seguro el resultado,
(mínimo 12 días). Detecta mosaicismos.
b- PCR o FISH-
De pruebas invasivas rápidas para detectar
13- 18-21 X e Y demora 24- 48 hs tanto de LA como vellosidad
Fish requiere más volumen de muestra y más tiempo que PCR- No es posible diferenciar contaminación
materna pero detecta mosaicos. PCR no detecta mosaicos debajo de 30%
c- Microarrays
Deleciones o duplicaciones muy pequeñas no visibles en
cariotipo. Puede hacerse de sangre, liquido A. tejido fetal etc.
Según el diseño, ˜ los CMA puede ser dirigidos (sondas localizadas en
regiones de interés para enfermedades concretas), de genoma completo (alta
densidad de sondas a lo largo de todo el genoma, utilizados sobre todo a nivel
de investigación) o de diseño˜ mixto (alta densidad de sondas en regiones de
interés y sondas con un nivel de densidad menor en el resto del genoma)
presenta las siguientes limitaciones: no detecta mutaciones
puntuales, expansiones de tripletes, reordenamientos equilibrados ni
mosaicismos de bajo grado
El fenotipo de estas CNV es impredecible, por lo que sólo
deben informarse en caso de concordancia entre el fenotipo ecográfico y el
hallazgo encontrado.
1.
Indicaciones
2.
TN aumentada más p99 con cariotipo normal
3.
Hallazgos ecográficos asociado con un síndrome
concreto
4.
Malformación ecográfica mayor- rciu severo
precoz.
5.
Antecedentes familiares de reordenamiento-
microdelecciones o traslocaciones.
e-Secuenciación masiva
en diagnóstico prenatal invasivo (paneles y exomas)
Está indicada en el diagnóstico molecular de enfermedades
hereditarias complejas con un fenotipo clínico heterogéneo y con diversidad de
genes implicados.
Es capaz de detectar mutaciones puntuales, pequeñas deleciones e inversiones y, mediante análisis
especiales, permite detectar ganancias y pérdidas de material cromosómico ≥ 7
Mb y pérdidas asociadas a deleciones específicas.
La secuenciación de exoma puede estar contemplada, por
ejemplo, en fetos con múltiples anomalías, o en casos de fenotipos fetales
recurrentes en los que no se ha alcanzado un diagnóstico mediante test
genéticos convencionales, como son cariotipo o microarray.
El Colegio Americano de Genética Clínica recomienda valorar
la secuenciación de exoma cuando no se ha conseguido el diagnóstico con test
genéticos específicos para un fenotipo, (incluyendo test de secuenciación
dirigidos ,entre los que se encuentran los paneles de genes de Sanger), en un
feto con múltiples anomalías congénitas que sugiera origen genético.
Identifica una anomalía genética hasta en un 20-30% de los
fetos con múltiples anormalidades y con resultados normales en los estudios
genéticos convencionales.
Hay un problema entre los hallazgos genéticos y su vinculación
con el fenotipo, muchas veces es incierta esa asociación.
Es costoso y laborioso
Los retos técnicos, éticos y de interpretación que plantea
la secuenciación genómica en su aplicación clínica son si cabe mayores en la
muestra prenatal, la historia clínica del feto es muy corta y solo la imagen
ecográfica contribuye al examen físico del feto.
Las características
fenotípicas de muchas enfermedades pueden no estar presentes en este período y
en el caso de enfermedades letales, nunca se conocerá el fenotipo completo
Frente a TN mayor de 3.5- o – RCIU severo precoz –o anomalías estructuraels
mayores, que hacer?
1.
Prueba invasiva PCR
2.
Si es patológica cariotipo
3.
Si es normal Microarray
Frente a sospecha de enfermedad monogénica de progenitores
1.
Prueba invasiva
2.
Secuenciación completa del o los genes
implicados
3.
Si secuenciación es normal completal con
cariotipo
4.
Si es patológico estudio parental
Riesgo de aneuploidías en screening o Progenitor portador de traslocación equilibrada
que implique cromosoma 13 o 21
1.
Test prenatal no invasivo (sangre materna)
2.
Si es patológico realizar prueba invasiva PCR y
cariotipo
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